Le FEICOM est certifié à la norme ISO 9001 depuis 2009 dans les domaines des Études, de l’Assistance-Conseil aux Élus locaux, de la Mobilisation des ressources, de la Conception, du financement et du suivi des projets de développement local. Il a réussi la migration de son Système de Management de la Qualité (SMQ) vers un système de Management Intégré qui a abouti à une deuxième certification en 2021, à la norme ISO 14001 version 20